Da ich Makerbot/CTC nicht kenne, kann ich dir leider nicht sagen, ob das Board auf Arduino basiert, wenn ja, ist das Flashen eigentlich einfach.
Aber auch sonst, sollte es eigentlich nicht so schwer sein, früher oder später wirst du es eh machen.
Vieleicht hat ein CTC User auch ein paar Tipps für dich bzgl. Sailfish
